Деятельность Московского Бюро ЮНЕСКО, основанного в 1994 году, первоначально ограничивалась сотрудничеством с Российской Федерацией. Однако в 2002 году, по настоянию ряда государств-членов, выступавших за более тесное и активное сотрудничество с ЮНЕСКО, сфера деятельности Московского Бюро была расширена как технически  (на данный момент она включает в себя полный спектр программной деятельности ЮНЕСКО), так и географически. На настоящий момент деятельность Бюро распространяется на  Азербайджан, Армению, Беларусь и Республику Молдова. Бюро ЮНЕСКО в Москве является единственным кластерным офисом Организации в Европе.

Основываясь на концептуальной основе и руководящих принципах, содержащихся в Программе и Бюджете ЮНЕСКО, одобренных Генеральной конференцией, Бюро разрабатывает и реализует двухлетний рабочий план и проекты для стран, на территории которых оно работает, в тесном сотрудничестве с Национальными комиссиями всех кластерных стран.

Для достижения  своих  целей Бюро ЮНЕСКО в Москве осуществляет совместную программную деятельность с  агентствами  ООН, работающими  в тех странах, на территории  которых  ЮНЕСКО не имеет своих офисов. Высокая квалификация специалистов, работающих в системе ООН и знакомых с местными проблемами, позволяет им эффективно решать задачи, стоящие перед ЮНЕСКО. Чтобы результативно использовать ресурсы и компетенцию  ЮНЕСКО в кластерных странах, Бюро ЮНЕСКО вместе с другими агентствами ООН принимает участие в подготовке таких документов, как Рамочная программа ООН по оказанию помощи в целях развития (ЮНДАФ/UNDAF), а также Общая страновая оценка (CCA).

Бюро будет стремится к тому, чтобы осуществление программ было качественным и эффективным с финансовой точки зрения. Необходимым условием улучшения качества любого проекта является наличие результата, а так же существование индикаторов, с помощью которых можно оценить уровень воздействия проекта.   Преимущество такой стратегии ЮНЕСКО видит в возможности  оценить значимость программ, количественно измерить результаты их реализации, усилить влияние деятельности ЮНЕСКО на местном и государственном уровне и укрепить сотрудничество между агентствами ООН, работающими на территории кластерных стран.

Для реализации этой стратегии Бюро ЮНЕСКО в Москве концентрирует свои усилия на развитии как многостороннего, так и двустороннего сотрудничества. С этой целью Бюро стремится к поиску новых форм сотрудничества с «членами семьи ЮНЕСКО»: Национальными комиссиями, государственными  комитетами межправительственных программ ЮНЕСКО, центрами 2 категории, кафедрами и ассоциированными школами ЮНЕСКО. Так же особое внимание уделяется поддержке развития гражданского общества в кластерных странах.