Le Kirghizistan a rejoint l’UNESCO le 2 juin 1992. Le pays dépend du bureau de l’UNESCO d’Almaty.
Le Kirghizistan a accueilli la conférence « Eurasie au XXIe siècle : Dialogue des cultures ou choc des civilisations ? » (Issyk-Kul, juin 2004). Le pays est aussi impliqué dans le projet de l’UNESCO d’élimination de la pauvreté par l’insertion sociale des jeunes marginalisés sans domicile.
L’UNESCO et le Kirghizistan ont joint leurs efforts pour sauvegarder l’art des Akyn, conteurs épiques kirghizs, une forme ancienne d’expression culturelle des nomades kirghizs. Cet art de narration, qui mêle le chant spirituel, l’improvisation et la composition musicale, a été proclamé chef-d’œuvre du patrimoine oral et immatériel de l’humanité de l’UNESCO en 2003. Un dossier, intitulé « Art des Akyns-conteurs épiques kirghizs en tant que partie intégrale du patrimoine oral et immatériel de l’humanité », a été élaboré à partir d’un travail mené sur le terrain afin de recueillir les créations orales des conteurs épiques Akyns.
Le pays a deux réserves de biosphères MAB, Issyk Kul et Sary-Chelek.