La République de Moldavie a rejoint l’UNESCO le 27 mai 1992. Elle dépend du bureau de l’Organisation situé à Moscou.
Le Programme L’éducation pour tous (EPT) a été intégré à la stratégie nationale moldave de réduction de la pauvreté, montrant ainsi la collaboration du gouvernement avec l’UNESCO. Un autre projet de collaboration pour la protection de la petite enfance a permis de fonder 12 centres communautaires avec du matériel éducationnel et des connexions Internet pour le bénéfice des enfants des zones rurales.
Le pays a deux Chaires UNESCO, la Chaire UNESCO d’études du Sud-Est européen à l’Université d’Etat de Moldavie et la Chaire UNESCO-Cousteau en Ecotechnie à l’Université technique de Moldavie.
La sauvegarde du patrimoine et la préservation de la diversité culturelle sont d’autres domaines d’intérêt pour la Moldavie.