Las ciencias ecológicas son fundamentales para el desarrollo sostenible. Los Programas de la UNESCO-Quito relacionados con la ecología se centran en una agenda de investigaciones interdisciplinaria que abarca lasdimensiones ecológicas, sociales y económicas de la pérdida de la biodiversidad y su reducción.

El enfoque de la UNESCO-Quito se dirige a los problemas sociales vinculados al manejo de los recursos naturales, la hidrogeología y el cambio climático. Las actividades relacionadas con la biodiversidad son mayormente conducidas a través del Programa del Hombre y la Biosfera (MAB). Este programa provee oportunidades de: reducir la pérdida de biodiversidad, mejorar la calidad de vida, y elevar las condiciones sociales, económicas y culturales, necesarias para un medio ambiente sostenible.