El Programa está abierto a las universidades y otras instituciones de enseñanza superior y de investigación reconocidas como instituciones de buena fe por las autoridades nacionales competentes del país respectivo y aceptadas por la UNESCO; a las organizaciones no gubernamentales que trabajan en el ámbito de la enseñanza superior y la investigación; a otras asociaciones académicas; a las redes interuniversitarias y otras redes académicas que deseen establecer un vínculo entre sus propias actividades y el Programa; y a las instituciones y organismos públicos o privados del ámbito nacional, regional e internacional que en la actualidad mantienen o tienen la intención de establecer vínculos de cooperación con la UNESCO.  

Cualquier institución que reúna los requisitos para participar en el Programa puede presentar una propuesta de proyecto para una Cátedra UNESCO o un programa de cooperación UNITWIN. Sin embargo, las Cátedras UNESCO y los Programas de Cooperación UNITWIN sólo se establecen en universidades, en otras instituciones de enseñanza superior o en instituciones de investigación en el ámbito de la enseñanza superior.

Después de registrarse por primera vez haciendo clic aquí, el responsable de una institución interesada envía a la UNESCO una propuesta de proyecto a través de Mi UNITWIN. La propuesta debe ajustarse a las prioridades de la UNESCO definidas en su Programa y Presupuesto y Estrategia a Plazo Medio aprobados, a las prioridades de los sectores y a los Objetivos de Desarrollo Sostenible. La propuesta debe ilustrar la doble función de las Cátedras UNESCO y los Programas de Cooperación UNITWIN como grupos de reflexión generadores de pensamiento y como constructores de puentes, y contribuir al fortalecimiento de la cooperación Norte-Sur, Sur-Sur y triangular, reforzando así el dinamismo de las redes y las asociaciones. Cada proyecto debe ir acompañado de una carta de apoyo de la Comisión Nacional de Cooperación con la UNESCO y de documentos que evidencien el apoyo de asociados institucionales y financieros nacionales, regionales y mundiales. 

La fecha límite para la recepción de nuevas propuestas es el 30 de abril de cada año. Se analizan los proyectos y se establece la Cátedra UNESCO o el Programa de Cooperación UNITWIN luego de una evaluación favorable. 

Las Cátedras y los Programas de Cooperación se establecen para un período de cuatro años. Éstos pueden continuar sus actividades más allá de este período inicial, luego de una evaluación positiva de un informe de progreso y planes futuros que deben enviar a la UNESCO.